Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnb1Q03717 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms