Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Runx1Q03347 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms