Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms