Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
GscQ02591 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
GscQ02591 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms