Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VcpQ01853 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms