Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pde1bQ01065 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pde1bQ01065 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms