Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp1P97350 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp1P97350 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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