Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Otx1P80205 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Otx1P80205 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms