Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SeboxP70368 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms