Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Hoxd13P70217 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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