Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snrpd1P62315 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snrpd1P62315 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms