Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rps29P62274 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rps29P62274 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms