Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1aP61092 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1aP61092 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms