Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SmoP56726 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SmoP56726 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SmoP56726 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SmoP56726 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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