Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atp5bP56480 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms