Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Irf5P56477 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Irf5P56477 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Irf5P56477 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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