Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcanP55066 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcanP55066 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms