Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgd1P52734 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms