Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpbP50405 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SftpbP50405 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpbP50405 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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