Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd4P46935 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd4P46935 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd4P46935 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd4P46935 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd4P46935 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd4P46935 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd4P46935 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd4P46935 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms