Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cdkn1bP46414 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms