Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Mmp9P41245 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Mmp9P41245 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mmp9P41245 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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