Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
TtlP38585 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TtlP38585 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms