Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SsbP32067 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SsbP32067 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SsbP32067 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SsbP32067 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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