Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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