Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
OatP29758 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
OatP29758 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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OatP29758 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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OatP29758 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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OatP29758 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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OatP29758 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
OatP29758 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
OatP29758 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms