Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb2P27090 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms