Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RarbP22605 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RarbP22605 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RarbP22605 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RarbP22605 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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