Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms