Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P20040 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P20040 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P20040 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms