Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cox4i1P19783 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox4i1P19783 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms