Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NefhP19246 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NefhP19246 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NefhP19246 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms