Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsdP18242 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsdP18242 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsdP18242 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsdP18242 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtsdP18242 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsdP18242 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtsdP18242 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms