Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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