Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PcnaP17918 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms