Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RhoP15409 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RhoP15409 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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