Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms