Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PolP10400 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PolP10400 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PolP10400 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms