Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtaP09225 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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LtaP09225 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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LtaP09225 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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LtaP09225 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LtaP09225 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LtaP09225 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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