Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb7P09024 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb7P09024 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms