Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Me1P06801 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Me1P06801 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Me1P06801 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms