Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P06323 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P06323 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P06323 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P06323 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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