Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PdgfrbP05622 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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