Protein–RNA interactions for Protein: P04941

Ig kappa chain V-VI region NQ2-48.2.2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04941 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P04941 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P04941 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P04941 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P04941 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P04941 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P04941 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P04941 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04941 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P04941 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P04941 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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P04941 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04941 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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