Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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