Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P04212 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P04212 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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