Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P03980 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P03980 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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