Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxa7P02830 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms