Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01641 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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P01641 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01641 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01641 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms