Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Serf1O88892 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms